Wydział Filozoficzny:

• dr Karol Petryszak – kierownik kierunku Filozofia
• dr Jagoda Stompór-Świderska – kierownik kierunku Psychologia

Wydział Historii i Dziedzictwa Kulturowego:

• dr hab. Cezary Kałużny, prof. UPJPII – kierownik kierunku Historia
• ks. prof. dr hab. Józef Marecki – kierownik kierunku Archiwistyka, zarządzanie dokumentacją i infobrokerstwo
• dr hab. Lucyna Rotter, prof. UPJPII – kierownik kierunku Turystyka i zarządzanie dziedzictwem oraz kierownik kierunku Turystyka historyczna
• dr Piotr Pajor – kierownik kierunku Historia sztuki
• dr Ewa Skotniczna –  kierownik kierunku Ochrona dóbr kultury
• dr hab. Susi Ferfoglia, prof. UPJPII –  kierownik kierunku Muzyka kościelna

Wydział Nauk Społecznych:

• dr Aleksandra Urzędowska –  kierownik kierunku Dziennikarstwo i komunikacja społeczna
• dr Agata Dziekan-Łanucha –  kierownik kierunku Komunikowanie promocyjno-wizerunkowe – reklama, branding, public relations
• ks. dr Maciej Radej–  kierownik kierunku Digital media – kreatywność, analiza, zarządzanie
• ks. dr hab. Jacek Siewiora, prof. UPJPII –  kierownik kierunku Pedagogika
• dr Katarzyna Wojtanowicz –  kierownik kierunku Praca socjalna
• ks. dr Marcin Cholewa –  kierownik kierunku Nauki o rodzinie

Wydział Prawa Kanonicznego:

• ks. dr Marcin Wolczko –  kierownik kierunku Prawo kanoniczne

Wydział Teologiczny i Wydział Teologiczny Sekcja w Tarnowie:

• ks. dr hab. Andrzej Kielian –  kierownik kierunku Teologia (w Krakowie i w Tarnowie)